กลุ่มวิจัยคุณภาพกาแฟ (Coffee Quality Research Group: CQR) สนับสนุนมหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวง มุ่งดำเนินงานวิจัยเพื่อยกระดับอุตสาหกรรมกาแฟไทยแบบครบวงจรตั้งแต่ต้นน้ำถึงปลายน้ำ ผ่านการสร้างสรรค์นวัตกรรมและบูรณาการองค์ความรู้ทางวิทยาศาสตร์เพื่อพัฒนาศักยภาพตลอดห่วงโซ่คุณค่าอย่างยั่งยืน
ทิศทางและพันธกิจการดำเนินงานวิจัย

1. นวัตกรรมการแปรรูป มุ่งศึกษาวิทยาศาสตร์การแปรรูปกาแฟเชิงลึก โดยเน้นเทคโนโลยีการหมักกาแฟ  และนิเวศวิทยาของจุลินทรีย์ เพื่อพัฒนาและสร้างสรรค์อัตลักษณ์รสชาติ ช่วยยกระดับคุณภาพและมูลค่าของเมล็ดกาแฟไทยสู่มาตรฐานสากล
2. การสร้างมูลค่าเพิ่มจากวัสดุเหลือทิ้งในกระบวนการผลิต ดำเนินงานวิจัยตามแนวทางเศรษฐกิจหมุนเวียนด้วยการศึกษากระบวนการสกัดและการนำผลพลอยได้ เช่น เปลือกกาแฟ  มาพัฒนาเป็นผลิตภัณฑ์ที่มีมูลค่าทางเศรษฐกิจ
3. การขยายเครือข่ายความร่วมมือระดับนานาชาติ สร้างและยกระดับความร่วมมือทางวิชาการ การแลกเปลี่ยนองค์ความรู้ และการทำวิจัยร่วมกับสถาบันการศึกษาและสถาบันวิจัยในภูมิภาคอาเซียน อาทิ ประเทศเวียดนามและอินโดนีเซีย เพื่อสร้างความเข้มแข็งทางวิชาการในระดับภูมิภาค
4. การถ่ายทอดเทคโนโลยีและบริการวิชาการแก่สังคม บูรณาการความร่วมมือกับสถาบันชาและกาแฟ มหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวงในการจัดหลักสูตรอบรมพัฒนาวิชาชีพ การจัดการประชุมวิชาการระดับนานาชาติ และการถ่ายทอดองค์ความรู้เชิงปฏิบัติ เพื่อเสริมสร้างขีดความสามารถในการแข่งขันของเกษตรกรและผู้ประกอบการกาแฟไทยอย่างเป็นรูปธรรม